La CONMEBOL organizará la tercera edición de la Copa Libertadores 2016 en Paraguay con la participación de todos los equipos de la región. Serán doce participantes y el ecuatoriano será Independiente del Valle.
River Plate (Campeón Copa Libertadores Sub-20 de 2012)
Invitado “Boca Juniors”
Paraguay
Cerro Porteño (Campeón Absoluto Torneo Apertura 2015)
Libertad (Campeón Absoluto Torneo Clausura 2015)
Brasil
San Pablo (Campeón de la Copa de Brasil Sub-20)
Bolivia
Bolívar (Campeón del Torneo Nacional Sub-20)
Chile
Huachipato (Campeón Nacional Fútbol Joven ANFP Sub-19)
Colombia
Cortuluá (Campeón del Torneo Sub-20 2015)
Ecuador
Independiente del Valle (Campeón del Campeonato de Reservas de 2015)
Perú
Melgar (Campeón del Torneo de Promoción y Reserva de 2015)
Uruguay
Liverpool (Campeón Anual Sub-19 de 2015)
Deportivo La Guaira (Campeón del Torneo Venezolano Sub-20)